La rápida propagación de la variante Delta muestra la necesidad de una identificación más veloz de las mutaciones de Covid-19. Uniendo a gobiernos y comunidades médicas en este desafío, Global Pathogen Analysis System (GPAS), de la Universidad de Oxford y Oracle Cloud System, está siendo usado por organizaciones de prácticamente cada continente. Entre las instituciones que usan la plataforma figuran el University of Montreal Hospital Centre Research Centre, el Institute of Public Health Research of Chile, la Oxford University Clinical Research Unit in Vietnam, el Institute of Clinical Pathology and Medical Research – New South Wales Pathology y Oxford Nanopore Technologies. GPAS forma también parte del Public Health England New Variant Assessment Platform.
El Global Pathogen Analysis System es ofrecido como un recurso gratuito para ayudar a combatir el Covid-19 y otras amenazas microbianas a la salud.
Creado gracias a Scalable Pathogen Pipeline Platform (SP3) de Oxford, a Oracle APEX y a la Oracle Cloud Infrastructure (OCI), Global Pathogen Analysis System es una plataforma en la nube que ofrece sistemas unificados y estandarizados para analizar y comparar secuencias de datos genómicos de SARS-CoV-2. Los investigadores están usando el sistema para colgar datos de patógenos y recibir resultados completos en cuestión de minutos.
Con permiso del usuario, los resultados pueden ser compartidos con los laboradores participantes alrededor del globo en un entorno seguro. Que estos datos sean completos y se puedan compartir ayudará a las autoridades de salud pública a evaluar y planificar su respuesta dándoles un valioso conocimiento de las variantes emergentes antes de que sean oficialmente designadas como variantes preocupantes.
Unir la comunidad global de investigadores en una misión común
“GPAS es el primer servicio del mundo basado en estándares de la industria y ofrece un servicio de análisis estandarizado de secuencias de datos para usuarios en la nube”, ha declarado Derrick Crook, profesor de microbiología en el Nuffield Department of Medicine de la Universidad de Oxfort.
“Los usuarios podrán acceder, colgar y procesar su secuencia de datos enteramente bajo su control y recibir datos analizados en solo 20 minutos. Si deciden compartir los datos, contribuirán a la visualización de datos globales que revelará los cambios diarios del progreso de la pandemia y cómo el virus está cambiando. Esto permitirá una evaluación continua de la pandemia y ayudará a guiar intervenciones nacionales y globales para modificar la curva de impacto del virus”.
